LncRNA (Long noncoding RNAs, LncRNAs) 长链非编码RNA， 起初被认为是基因组转录的“噪音”，是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能。然而，近年来的研究表明，LncRNA参与了X染色体沉默（图A），基因组印记以及染色质修饰，转录激活（图B），转录干扰，核内运输等多种重要的调控过程，LncRNA的这些调控作用也开始引起人们广泛的关注。

哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是LncRNA（相应的蛋白编码RNA的比例是1%），虽然近年来关于LncRNA的研究进展迅猛，但是绝大部分LncRNA的功能仍不清楚，随着研究的推进，各类 LncRNA 的大量发现，LncRNA 的研究将是 RNA 基因组研究非常吸引人的一个方向，使人们逐渐认识到基因组存在人类知之甚少的“暗物质”。

LncRNA的调控机制研究包括

A、表观遗传研究-DNA甲基化：利用MSP、BSP技术，研究LncRNA对DNA甲基化的调控。

表观遗传研究-染色质重塑：利用ChIP技术，研究LncRNA对染色质重塑的调控。

转录调控研究：通过EMSA、RIP（下图所示）、ChIRP、Co-IP等技术，研究LncRNA与转录因子间的相互作用。